ChIP-seq 분석에서 피크 호출 및 후처리
피크 탐지 개요
전사 인자 Myc의 게놈 내 결합 부위를 규명하기 위해선 차등적으로 리드가 축적된 영역을 식별하는 피크 콜러(peak caller) 도구가 필요하다. 다양한 알고리즘이 존재하지만, 현재까지도 가장 신뢰성 있고 널리 사용되는 도구는 MACS2이다. MACS2는 다음 단계를 통해 유의미한 피크를 도출한다:
시퀀싱 리드로부터 프래그먼트 길이 추정
각 리드를 추 ...
5월 21일 11:14에 게시됨